酶工程其实就是将酶学的相应理论以及化学工业技术的相结合，而在现代意义当中的酶工程也就是近几十年才逐渐兴起来了，它可以被划归到是技术性的学科里面，随着微生物技术的发展，酶的分离技术以及应用逐渐开始被人们所关注，并且把它应用到了很多的领域当中。
酶也可以是被看做是生物体当中的具有催化作用的特定的蛋白质，它有着特定的作用它可以催化或者说促成某种反映，而自身却不参加反映，催化的效率高，而且也比较稳定同时反映的产物所产生的污染也比较小，能耗也比较的低与传统的化学反映其自身有着很大的优越性。
1、蛋白酶。应用的比较广泛，通过微生物的提取，特别是应用到食品领域当中，例如木瓜蛋白酶就可以制作饮料，像我们日常生活当中常见的啤酒，果汁一类的，它可以有效的去除点饮料存放时间久后出现的浑浊物质。也可以应用到制作饼干，糖果以及肉类，你比如说炖肉是添加一些木瓜蛋白酶可以是肉保持鲜美和容易煮嫩。
2、淀粉水解酶。在淀粉水解工业当中往往是应用到麦芽糖以及葡萄糖等制作当中。主要就是利用淀粉酶液化最后在糖化提取。它也可以应用在制酒以及酱油等，目的就是通过淀粉酶液化便于微生物的利用。
3、蔗糖酶。蔗糖酶就是可以很好的进行分离，使蔗糖水解成果糖和葡萄糖从而来增加其甜度，防止蔗糖固化而结晶，如今已经广泛的应用到食品工业领域当中。
4、其他酶。葡萄糖氧化酶，在日常生活当中你会发现葡萄糖浆尤其是在运输过程当中储存是比较困难的，正好可以利用葡萄糖氧化酶进行转化，使其产生晶体便于运输存储;青霉素酰化酶是利用水解青霉素从而改进青霉素的低毒性;脂肪酶，可以分解动物的脂肪，使脂肪酸和甘油就行分裂，同时也可以配合蛋白酶制作成消化剂，往往应用在皮革领用当中主要就是进行脱脂清洗的作用;纤维素酶它可以分解植物当中的纤维素，这样在饲料的加工的过程当中可以是饲料精细化，有助于提高纤维素的可消化性。
